Tips för projektarbetet

Under projektarbetet gäller det att arbeta självständigt. Du kommer troligen att behöva en email adress så om du inte har fått det redan är det hög tid att skaffa en nu genast.

Hjälp

Vi, Jakob, martin, Magnus, Agnes, hjälper gärna till med det vi kan. Någon av oss kommer att finnas tillgängliga varje dag då och då i datorsalen, däremellan kan vi helst nås på email eller igenom att komma upp till oss vi sis biokemi institutionen.

Hitta information

När det gäller projektarbetet så är Entrez ett av det bästa stället att börja din sökning på. Sen är det självklart bra att använda t.ex. pedros lista över länkar för att kunna leta reda på de verktyg du behöver. Vi uppskattar extra mycket ifall du hittar användbara verktyg som vi inte beskrivit under kursen. För varje protein som du hittar är det nog bra att göra en blast (eller fasta) sökning. Dessutom bör du försöka ta reda på om strukturen hos detta protein är känt eller inte. Du kan också ta reda på vilken familj dina proteiner tillhör.

Allmän information om problemområdet kan man få genom att t.ex. läsa Abstracts i Medline, hämta hem någon artikel i Journal of Biological Chemistry (i bästa fall kanske du hittar någon review artikel), kolla OMIM-databasen ('Online Medelian Inheritance in Man'), och med hjälp av en generell sökmaskin som MetaCrawler. Gå bara till Biologibibiloteket i yttersta nödfall, t.ex. om detta är enda sättet att få fram en bild av en struktur.

Tips

Slutligen är det nog bra att ni ser till att ta god tid på er så att ni hinner skriva ner era resultat och göra en snygg hemsida. Tänk också på att det är viktagare att visa hur ni har tänkt när ni har valt att använda en speciell server än att uppnå fantastiska resultat, så redovisa även de resultat som inte gav några speciellt intressanta fakta.

Byte av projektarbete. Ifall du känner att det är helt omöjligt att ta reda på någonting intressant om dit projekt så kan man undantagsvis få tillstånd att byta projekt. Observera att detta bör ske redan på måndagen ifall man inte vill spendera hela nätterna med att göra klart projektarbetet.

Utfrande av hemsidan

Publicera din hemsida här genoma att använda Netscape Gold's Publish-funktion under File/Publish enligt instruktioner Observera att din huvud hemsida skall heta "index.html". Annars fungerar inte länkarna.

Ett bra tips är att göra hemsidan med netscapes editor. Allting kommer också att fungera mycket bättre om ni skapar ett eget directory (folder) pch där lägger alla bilder och hemsidor som ni har. Använd inte heller åäö eller mellanslag i namnen, det kommer inte att fungera. Det är också bäst om ni bara använder små boksäver. Slutligen bör man kalla filerna på så sätt att programmet servern vet ad de är fär typ av filer. Hemsidor skall heta .html, bilder .gif eller .jpg osv När ni anser er klara med hemsidan så kan ni använda "publish" från netscape för att lägga upp hemsidan på servern. Ni skall ange servern som ftp.biokemi.su.se, och det användarnamn och lösenord som ni har fått. Era hemsidor kommer att finnas på /~användarnamn


Arne Elofsson
Last modified: Wed May 3 11:05:58 CEST 2000